Gen. dyw. Michał Sikora rozpoczął służbę wojskową w 27 batalionie radiotechnicznym na stanowisku inżyniera stacji radiolokacyjnej w 271 kompanii radiotechnicznej w Kołbaskowie. Od 1989 r. dowodził 271 kompanią radiotechniczną. W 1993 r., po ukończeniu studiów w Akademii Obrony Narodowej, został dowódcą 25 batalionu radiotechnicznego w Debrznie, a w 1995 r. dowódcą 28 batalionu radiotechnicznego w Gryficach.

W 2008 r. przejął dowodzenie 3 Brygadą Radiotechniczną we Wrocławiu oraz został nominowany na stopień generała brygady. Od 2009 r. pełnił służbę wojskową w Dowództwie Sił Powietrznych, na stanowisku szefa Wojsk Radiotechnicznych, a od 2011 r. został wyznaczony na stanowisko szefa Wojsk OPL i Radiotechnicznych.

Od sierpnia 2013 r. był szefem Zespołu ds. Inspektoratu Rodzajów Wojsk Grupy Organizacyjnej Dowództwa Generalnego RSZ. Od 1 stycznia 2014 r. do 4 marca 2016 roku pełnił obowiązki na stanowisku  Inspektora Rodzajów Wojsk Dowództwa Generalnego RSZ. 1 sierpnia 2015 r. odebrał z rąk prezydenta nominację na stopień generała dywizji. Z dniem 5 marca 2016 r. został wyznaczony na stanowisko szefa Sztabu w Dowództwie Generalnym Rodzajów Sił Zbrojnych.

– Przystępuje Pan do struktury organizacyjnej, która ma za sobą dziesiątki lat doświadczeń. Olbrzymie osiągnięcia na swoim koncie. Nie mam wątpliwości, że Pana służba w nowych okolicznościach i wyzwaniach, jakie są wymagane, będzie służbą, która te najlepsze doświadczenia jeszcze bardziej pomnoży – powiedział podczas uroczystości w Sztabie Generalnym WP Antoni Macierewicz. Szef MON stwierdził, że gen. Sikora będzie dobrym wsparcie dla doświadczeń, jakie przez dziesiątki lat zebrał Sztab. Pierwszy zastępca szefa Sztabu SGWP, obejmując swoje obowiązki, podziękował ministrowi za zaufanie i zadeklarował "realizację zadań na najwyższym poziomie merytorycznym".